在圣婴现象造成的干旱有所和缓后，巴拿马运河的船舶抵达数量已开始回升，但专家警告，未来一旦圣婴现象又发威，当局可能再度被迫限制船只通过数量。
英国金融时报（FT）报导，Marine Traffic数据显示，在历经六个多月的扰乱后，巴拿马运河今年4月的船只抵达数量为739艘，虽不如去年同期的1,026艘，但已比2月低点692艘显著回升。
在去年6月，加通湖水位降至历史低点，直到今年3月中才回升。加通湖是运河调整船闸水位的水源。
受干旱冲击，巴拿马运河管理局被迫限制船舶数量，许多船只排队等候数周才能通过运河。巴拿马通常是全球降雨最丰的国家之一。在接下来5月~12月的雨季，运河水位预料将提高逾2公尺。
世界气候归因组织（World Weather Attribution，WWA）日前发布的研究显示，在2023年，圣婴现象使太平洋海平面升温，导致巴拿马去年的降雨量比往常减少约25%，是当地历来第三干旱的年份。
WWA研究员指出，在2023年，把巴拿马降雨稀少几率提高一倍的成因是圣婴现象，而非温室效应。
红十字与红新月气候中心风险顾问瓦尔贝格说，相比前几次干旱，巴拿马当地社区缺水的情况较不严重，「对通行运河的船只设限，确保加通湖的水位没下降到危险的程度，而巴拿马的居民遭遇的缺水没2015、2016年严重。这几年也都遇到圣婴现象。
WWA科学家警告，巴拿马运河管理局为了确保当地居民有充足的饮用水，未来可能再度被迫减少船只通过数量，尤其是在圣婴年。
Kpler农业商品首席分析师巴努说，在干旱期间，随着航运延迟引发成本攀高疑虑，干散货船行经巴拿马运河的数量锐减。巴努表示，由于干散货船装载了最便宜的货品，运河通行费会推高每吨货物的运价，因此这类船只宁愿绕远路。
受干旱影响，巴拿马运河通行费的竞标价格冲上历史新高，在去年干旱最严重时，达到创纪录的400万美元。
