副总统赖清德将在五二○就任新总统，民进党内认为，赖清德在选前已多次宣示将延续蔡英文总统的两岸外交路线，因此在国安团队方面，大幅异动的可能性有限；有党内人士认为，国安会秘书长顾立雄、副秘书长陈文政与徐斯俭，以及国安局长蔡明彦等几位蔡总统国安团队的内核官员，留任的机会很大。
两岸局势紧绷，国安团队是赖清德布局的重中之重。民进党内人士分析，过去八年，蔡英文的两岸外交关系稳健、不躁进，尤其是台美关系成果外界有目共睹；赖清德在选前多次表态，将延续「蔡英文路线」，因此国安团队大幅换血的可能性很低，赖政府执政初期，有望沿用蔡政府的国安人事。
另一位党内人士指出，顾立雄不会裸退，问题只在「哪个位置」；国安圈内评估，顾立雄留任国安会秘书长的机会很高，另外有人认为，可让顾立雄接任国防部长，后者思维是，近年国防部沉疴太重，顾立雄没有包袱，虽然未必能彻底改革，但可以当一个「推动大象的角色」。
党内人士指出，副总统当选人萧美琴已经进入决策圈，她娴熟国安团队，高层也有一定共识，初期会是个「有实权的副总统」。至于顾立雄留任与否，牵涉三个角度，蔡总统的想法、赖清德的期待、美方的看法，三方必须做平衡。
国安人士指出，赖清德延续蔡英文路线，国安团队不要变动太大是确定的，除了萧美琴之外，顾立雄、国安会副秘书长、国安局长蔡明彦等几位内核人物都会留任，「但在哪个位子可能会有异动」。
此外，因为金厦海域争议成为在野党箭靶的海委会主委管碧玲是否留任也受到瞩目。海巡署昨在高雄举办云林舰交船典礼，蔡英文、赖清德首次同台交船，更与管碧玲「同框」，虽然这项行程早已安排，但蔡致词时特别感谢管碧玲，此举也被解读为高层力挺「管主委」意味浓厚。
基于维安考量，正副总统鲜少同时出现在相同的公开行程，而本次蔡英文、赖清德一同出席交船仪式，不仅象征「双总统」力挺海巡，蔡英文还刻意让赖清德走在前方，也有交接国防事务的意味。