日本航空编号516班机2日降落羽田机场时与海上保安厅定翼机发生追撞起火意外，日本产经新闻报导，唯一幸存的海保机长接受访问时解释，当时听到塔台下达「获准进跑道」指令，也向机上5名组员进行确认，但没人察觉有异状，代表很可能是全员将塔台的「第一顺位预备起飞」误解为「第一顺位起飞」。
报导指出，根据日本国土交通省公开的飞行纪录显示，2日下午5时45分，塔台管制员向海保机指示，「第一顺位。请在地面滑行至C5跑道的滑行道等待。」
8秒后，海保机机长宫本元气回复道，「正在前往。」然而随后却直接进入跑道并停留长达40秒。期间，塔台管制员也并未发现海保机违反指令闯入跑道。
海上保安厅内部人士指出，机长与罹难的5名队员全都有佩戴机上的航空耳麦，也就是说全员都能听见机长与塔台在对讲机内的对话。
机长最初获救时一再声称，已获得塔台许可进入跑道，事后面对调查时表示，「当时曾经和其他组员重复确认塔台指令。」
以此来看，海保机队员很有可能全体误将塔台的「第一顺位准备」，误解为「第一顺位起飞」，也就是等日航编号516班机降落后第一顺位起飞。